青海省第五人民医院始建于1958年，前身为西宁铁路医院，2004年原铁路医院移交地方后更名青海省第五人民医院。2011年评为青海省唯一“市、县级医院常见肿瘤规范化诊疗指导医院”，承担了原卫生部乳腺癌、宫颈癌两癌筛查以及国家、省级多项科研课题，获得国家科技进步二等奖等多项科研奖励。2016年确定为“西安交通大学研究生教学基地”。

2017年成为全国肿瘤专科联盟成员单位、2018年被省编办批复为青海省肿瘤医院、2018年牵头成立青海省超声医学工程学会。连续多年获评“全国百姓放心示范医院”、“全国敬老文明号”单位、省卫生健康委员会“改革创新先进单位”等荣誉称号，2019年被评为“中国美医院”、2021年增挂青海大学附属第五医院。作为“省级干部保健基地医院”，目前医院已发展成为集医疗、教学、科研、康复为一体的三级甲等综合医院。

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