中国人民解放军东部战区空军医院前身为华东军区空军医疗队，1951年10月建院，是南京首批综合性三级甲等医院，是南京市城镇职工医保、居民医保定点医院，南京市急救中心分站，南京市劳动能力鉴定检查定点医院，省、市“三信三优”单位，省新农合省级联网医院，全军第二批宇航员遴选体检定点医院，全军交通医学研究所南京临床基地，东部战区临床航空医学研究所，东部战区创伤骨科中心，东部战区中医诊疗中心，东部战区心肺康复中心。

医院现有美国GE16排PET-CT、西门子1.5T超导磁共振、GE64排螺旋CT、美国医科达直线加速器、头部伽玛刀、西门子S-2000彩超、C型臂X线数字減影机、数字胃肠、DR、外周血干细胞分离机、体外碎石机、腔内钬激光碎石机、关节镜治疗系统、臭氧治疗机、电子腹腔镜、电子超细胃镜、肠镜、电子十二指肠镜、经颅多谱勒仪及脑干诱发电位等大型医疗设备。

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