南方医院系南方医科大学（原第一军医大学）第一附属医院、第一临床医学院，是一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院，全国百佳医院。医院创建于1941年，2004年8月随大学由军队移交广东省。

医院设置专业学科52个，是临床医学博士后流动站；临床医学一级学科是博士学位授权学科，口腔医学一级学科为硕士学位授权学科。内科学（消化系病）是国家重点学科，外科学（骨外）是国家重点培育学科，消化内科、骨科、妇科、产科、检验科、病理科是国家临床重点专科，内科学、外科学、肿瘤学、影像医学与核医学等4个二级学科为广东省重点学科，消化内科、肾内科、感染内科、脊柱骨病外科、围产医学为广东省重点医学专科；器官衰竭防治研究实验室为教育部-广东省共建重点实验室，肾功能衰竭研究实验室、病毒性肝炎研究实验室、骨与软骨再生医学实验室、胃肠疾病实验室为省级重点实验室；有国家中药和西药临床试验机构各1个；2010年，广东省肾脏病研究所在医院挂牌成立。

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